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多重序列比對

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多重序列比對(Multiple sequence alignment;MSA)是對三個(gè)以上的生物學(xué)序列(biological sequence),如蛋白質(zhì)序列、DNA序列或RNA序列所作的序列比對。一般來說,是輸入一組假定擁有演化關(guān)系的序列。從MSA的結(jié)果可推導(dǎo)出序列的同源性,而種系發(fā)生關(guān)系也可引導(dǎo)出這些序列共同的演化始祖。如右圖般的視覺化敘述可描繪出各種突變事件,例如點(diǎn)突變的單格變化,或是如刪除突變與插入突變,可使各個(gè)序列之間產(chǎn)生鴻溝。MSA常用來研究序列的保守性(conservation),或是蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域三級(jí)結(jié)構(gòu)二級(jí)結(jié)構(gòu),甚至是個(gè)別的氨基酸核苷酸

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